Die Commandeursmolen ist trotz ihres hohen Auftragsvolumens keine Fabrik. Durch die Unternehmensvergrößerung und Automatisierung ist sie jedoch auch keine gewöhnliche Mühle mehr. Es ist eine Müllerei, deren heutige hohe Qualitäts- und Effizienzansprüche auf jahrhundertealte handwerkliche Technik basieren.

Die Commandeursmolen verfügt über sieben Mahlgänge und einen großen Silokomplex von 12 x 30 t. Die Infrastruktur umfasst eine moderne Getreidereinigungsanlage, getrennte Produktionslinien für Mehl das in etwa bis Type 750 entspricht und Mehl das in etwa Type 550 bis 650 entspricht, geschiedene Mischkessel, Mehlbunker, eine Transportlinie mit Palettierungsanlage sowie eine Filteranlage. Die zentrale SPS-Steuerung mit vollautomatischen Waagen für verschiedene Mehlsorten und Kleie ermöglicht es, jedes gewünschte Produkt zu liefern.