De Commandeursmolen fabriceert zijn producten op een duurzame manier, met respect voor milieu en gezondheid. Veiligheid en kwaliteit staan hoog in het vaandel. Het bedrijf beantwoordt dan ook aan de hoge eisen op dit gebied en is onder meer Skal, NOP en Demeter (biologisch) gecertificeerd. Dat geldt natuurlijk ook met betrekking tot HACCP en GMP+.